Обучение сотрудника ООО

Здравствуйте, я бухгалтер организации ООО «Мебель», работаю первый год. При проверки налоговой был выявлен факт недоимок по уплате налога на доходы физических лиц, образовавшихся в результате того, что я не произвела удержание по налогу с дохода сотрудника ООО «Мебель», обучающегося в Вузе по нашему направлению. Мы подали протокол разногласий, в котором выразили свое несогласие с выявленными недоимками, мотивируя это тем, что между нами и вузом был заключен договор на обучение сотрудника нашей организации. Денежные средства, выделенные на обучение в вузе, наш сотрудник на руки не получал (они были перечислены в бухгалтерию вуза по договору нашей бухгалтерией). По нашему мнению, данные суммы не могут быть отнесены к доходу физического лица – данного работника. Подскажите, пожалуйста, как должен поступить руководитель налоговой инспекции при рассмотрении протокола разногласий? И сколько может быть вариантов разрешения спора. Спасибо огромное за отклик)