Каков порядок увольнения в моей ситуации

Написать заявление на увольнение. Я обучался за счет предприятия по ученическому договору, по условию которого я должен отработать 5 лет либо вернуть все затраченные средства. После обучения пришел на отработку. Через 4 месяца меня призвали на службу в армию, вернувшись продолжил отработку. На данный момент организация перешла на сокращенный режим работы в зимнее время — 5 дней дома 2 работаем. Об этом режиме нас оповестили за 2 месяца до начала, где я дал свое согласие. На данный момент мне предложили работу в более престижной фирме со всеми привилегиями. Сейчас я уже отработал 4,5 года — 4 месяца до армии + 1 год армии+ 3,2 года до настоящего времени. При увольнении организация сделает все чтоб меня удержать (т.е. сначала предоставят полную рабочую неделю и попросят выплатить всю сумму). За время моей работы неоднократно нарушалось законодательство ТК РФ: ненормированный рабочий день, дополнительного отпуска не предоставлялось, в месяц набегало по 60-70 часов переработки при этом половина ночных(в некоторые дни работал по 14-16 часов), не оплачивались климатические условия и за высокий шум и это все за оклад + премия указанные в коллективном договоре и отдельном трудовом договоре. На данный момент я желаю написать заявление на увольнение, чтоб ко мне организация не имела материальных претензий, но без привлечения прокуратуры с моей стороны. Каков порядок увольнения в моей ситуации? Считается ли что 5 лет я отработал?